起义士兵和市民还攻入后宫，四处追杀闵妃。
闵妃在混乱中急忙化装成宫女，在武艺别监洪在羲（后改名洪启薰）的保护下逃离王宫，藏身于老家骊州郡的亲戚闵泳纬家中。
她逃走时得到了骊兴府大夫人闵氏（大院君之妻）的协助，府大夫人将四人轿借给闵妃，而在闵妃出宫时，郑义吉等起义士兵掀开四人轿将闵妃拖出，洪在羲急中生智，大呼“此吾妹尚宫也！”
闵妃逃出了汉城，逃不出汉城外围的华军警备司令部的封锁区，仍然被抓住了。
但是华军秘而不宣。
权倾朝野的闵妃集团就这样在士兵和市民的怒吼下土崩瓦解，局势变得一发不可收拾。
朝鲜高宗李熙面对这种突发状况，惊慌失措，被迫急召大院君入宫随侍，自己避往别殿，并宣布归政于大院君以挽回局面，大院君便与其妻骊兴府大夫人和长子李载冕一起进宫。
大院君如愿以偿，在起义士兵和市民的拥护下第二次掌权摄政。
大院君执政后第一件事就是收拾宫廷的乱局。
此时宫中涌入成千上万的士兵和市民，搜寻闵妃，捕杀官吏，刹那间变得腥风血雨、混乱不堪。
大院君先命令士兵撤出宫廷，不料士兵们表示：“中殿（王妃）在，必尽戮我等；死，宁行大事而死，决不敢退！”
大院君不得已，马上宣布闵妃已死于乱军中，并发布国丧。他还下令赦免起义士兵和市民，遣散他们出宫，并发给士兵积欠的军饷。起义士兵和市民这才放下武器，从昌德宫撤走。壬午兵变暂时平息下去。
兴宣大院君再次执政后，全面废除了闵妃集团所实行的开放措施。
他首先进行人事调换，罢斥了闵妃集团的余党，起用自己的亲信和申应朝等保守士大夫，释放了因反对开放国门而下狱的郑显德、李晚孙、金平默等官员和儒生。
他还让自己的长子李载冕兼任武卫大将、户曹判书、宣惠厅堂上等重要职务，掌握兵权和财政。除了人事的安排外，大院君在夺回权力之后，亦立即着手推行改革以缓解社会危机。
兴宣大院君李昰应先下令把京城附近郡邑的粮米运往京城，作为军士的俸米及民众的粮食。
此后，他又下令严禁私自铸造货币，以维护国家的利益。
除此之外，他更废除都贾制度，强调人人均须纳税，并将地方物产直接运至汉城，以免各地豪强从中取得非法利益。
接着又宣布恢复五营军和三军府，废除别技军，裁撤统理机务衙门等命令。
随后几日，民间谣传闵泳翊等逃亡在外的闵妃集团残余势力纠合褓负商数万人，准备进京洗城。当时“都下大乱，坊民俱勒帕揭竿，冲塞街巷，声言御贼，势如潮涌”。
大院君则亲自走出敦化门，安抚汉城百姓，并宣布关闭城门，开放武库，将武器发给大家共同防备。
于是士兵和市民又一次武装起来，展开了对闵妃集团的新一轮清洗，不少人被认为是褓负商而死于非命，又有许多闵姓外戚和主张开放政策的官员相继为起义士兵和市民所杀，甚至连进京赶考的举子也被当作褓负商的内应而被杀害，原因仅仅是因为袖子里藏着的应举花名册被认为是褓负商名单。
从这个褓负商谣言事件可以看出民心对闵妃的恐惧怨毒和对大院君的支持信服。
与此同时，大院君还下令在全国范围内对闵妃集团成员发下海捕文书，密遣御史到各地探察避难者情况。
起义士兵将逃亡官僚的家产没收，并殴打辱骂在汉城设置的闵妃望哭处吊祭的人士。
他们还捣毁了城郊附近寺庙，因为这些寺庙被认为是闵妃滥施祈福而挥霍钱财的巢穴。
起义士兵也不相信闵妃已死，仍到处搜捕闵妃。
闵妃被迫离开靠近京城的骊州郡，在洪在羲、尹泰骏、闵应植、闵肯植、李容翊等人的护送下向南逃亡到忠州长湖院避难。
兵变本来是朝鲜的内乱，但因为其引发的排日风潮而使事件极大地复杂化。
兵变中日本人的蒙难令日本舆论大为震惊，朝野争论不休。
“面对现在这种老百姓集体要求大人担任执政的情绪，我们该怎么办？是否……”李载冕问道。
“别急别急，你让我再想一想。”兴宣大院君李昰应叹口气，背过身去。
现在还能怎么办？
对于兴宣大院君李昰应来说，只有两条路走，要么就是乖乖的让出位置，为华皇做嫁衣，要么就是横下一条心，跟华皇对抗到底。
正好现在华军有一部分军队在日本，而且后勤补给困难，加上朝鲜这边有叛军，所以，这是兴宣大院君李昰应的一个好机会！
李昰应为人果断，个性极强，与闵妃你死我活的权力争夺埋下了朝鲜亡国的种子。
与大院君处于大致相同时代的人对大院君的评价虽然有肯定和否定之分，但都可以归结为一个“惜”字。
乃云岘者，流涎壮金（壮金：即安东金氏）之富贵，一朝得志，淫侈骄狼，猖狂自恣，视壮金而又过之。斫伤元气，结怨黔黎，徒以穷心土木，左袒色目，为十年事业。呜呼！时耶？运耶？千载之下，亦必有叹息痛恨于斯者。
同时又对他的一生总结道：“昰应十年秉钧，功罪参半。
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