流寇水师的突然撤离，让孙传庭喜出望外，尽管说流寇撤离到襄阳府城之后，意味着进攻府城的难度增加，不过只要能够尽快的展开对府城的进攻，其余的暂时不用考虑。
孙传庭与陈新甲等人商议之后，决定在十二月初一展开对襄阳府城的进攻。
流寇的水师已经展现出来不一般的战斗力，也让孙传庭知道了，接下来攻打襄阳府城，难度会特别的大，想着短时间之内拿下襄阳府城，几乎是不可能的事情，故而在商量具体战术的时候，孙传庭倾向于四面合围，围困城内的流寇，同时采取小规模的骚扰式的攻城战术，让城内的流寇时刻处于高度紧张的状态，一旦流寇出现难以支撑的情况，再来展开大规模的攻打城池的战斗，要做到这一点，就必须要保证大军粮草的充足。
孙传庭给出的攻打襄阳府城的战斗时间为两个月左右，既在崇祯十四年的二月之前，争取能够拿下襄阳府城。
应该说孙传庭的这个作战计划，是充分考虑到流寇的战斗力，也考虑到攻打襄阳府城的艰辛，可惜孙传庭的作战计划，遭遇到陈新甲的否定。
从九月份开始的战斗，需要持续到来年的二月，还不知道能不能拿下襄阳府城，这不是陈新甲能够忍受的，再说十几万的大军围困襄阳府城，谁知道固守新野和信阳的贺人龙能够坚持多长的时间，谁知道郧阳的刘文秀、李定国和艾能奇等人，是不是会驰援襄阳府城，若是大军不能够很快的拿下襄阳府城，一旦城内的流寇得到了外部的增援，甚至是遭遇到李自成和张献忠的联合，那么战斗的结局就不好说了。
在陈新甲的内心，对于流寇的战斗力还是小视的，他不认为流寇战斗力强悍。
陈新甲与孙传庭之间的理念不一样，所要采取的战斗模式自然是不一样的。
这一次孙传庭没有退缩，他很清楚贸然展开强攻，会是什么样的后果，大军的损失一定是惨重的，这种惨重的损失，对于大军的士气是毁灭性的打击。
陈新甲和孙传庭两人的意见不能够统一，以至于影响到了准备好的十二月初一的进攻。
陈新甲一意孤行，坚持自身的意见，他认为孙传庭胆小怯战，先前攻打流寇的水师，就持续了十多天的时间，若不是流寇的水师主动撤入到城内，还不知道什么时候能够被打败，这充分说明了孙传庭指挥作战的时候，畏首畏尾，没有能够拿出来全部的力量。
陈新甲坚持对襄阳府城展开总攻，孙传庭坚决不同意，其余人没有表现出来态度。
一气之下的陈新甲，给内阁大臣、兵部尚书杨嗣昌写去了信函，孙传庭不甘示弱，也给杨嗣昌写去了信函，两人分别说明了原因。
一直到十二月中旬，兵部的敕书到了，其意见是支持陈新甲。
也就是说，进攻襄阳府城的战斗，必须是速战速决，必须是大规模的进攻。
敕书罕见的训斥了五省总督孙传庭，认为孙传庭的确是怯战。
这让陈新甲和孙传庭都明白了，所谓兵部的敕书，其实就是皇上的意思，皇上没有下圣旨，可能是考虑到进攻襄阳府城的战斗正在进行之中。
兵部的敕书训斥孙传庭，这是很少见的情况，也是几乎不可能发生的情况，偏偏发生了，可见皇上对于已经开始的剿灭流寇的战斗，是很不满意的，其实贺人龙固守新野和信阳，暂时没有针对李自成展开总攻，这已经透露出来陈新甲和孙传庭的作战意图，那就是重点是针对张献忠、防止李自成与张献忠之间的联合，这样的作战意图，皇上不可能不清楚，但木已成舟，皇上不好怎么反对，只能够是默认，如今孙传庭准备稳扎稳打，皇上好不容易找到了出气的地方，怕是大发雷霆的，可以想象朝中大臣是劝慰过的，要不然孙传庭还有可能遭受到更加严厉的惩罚。
事情到了这一步，陈新甲和孙传庭都是没有想到的。
孙传庭很快改变了自身的态度，他已经知道不能够坚持稳扎稳打的意见了，要不然皇上就真的会责怪了，所以他开始和陈新甲商议，究竟该如何展开进攻。
中军帐，一场重要的讨论展开。
“本官建议从陆路和水路两个方向展开进攻，陆路进攻以南门为主，水路进攻以西门为主，两个方向展开进攻，流寇不好防御，陆路和水路的进攻相互配合，就能够以最快的速度拿下襄阳府城。。。”
陈新甲对着地图说出了他的计划，这也是他早就思索好的作战计划。
孙传庭一直都有些沉默，突然改变作战计划，且皇上已经有些不满意了，这些都需要时间来接受和消化，从目前的情形来说，孙传庭还找不到最好的进攻办法，也就是说攻打襄阳府城的战斗，注定是异常血战，或者说是一场持久战，短时间想着拿下襄阳府城，几乎是没有什么可能性的。
大军的粮草已经维持不了多长的时间，陈新甲和孙传庭已经给湖广巡抚方孔炤写去了信函，要求方孔炤开始陆续的运送粮草，保证大军的供给，陕西与四川的方向，陈新甲也写去了信函，要求陕西迅速文震亨以及四川总兵秦良玉，无比想办法拖延住刘文秀、李定国和艾能奇率领的流寇，至于说贺人龙，肩负的职责就更加的重要了，必须要守住新野和信阳两座城池，防止李自成与张献忠之间的联合。
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